以成为神奇宝贝大师为目标，小智（松本梨香 配音）、小刚（うえだゆうじ 配音）和小光（豊口めぐみ 配音）带着各自的神奇宝贝在世界各地进行艰苦的修业之旅，今天他们历经长途跋涉终于来到了风景秀美的米琪亚镇。在当地一对小兄妹的介绍下，小智一行前往神殿遗址游玩。谁知却遭遇了极其危险的情况。关键时刻，掌管时间的迪亚鲁加和守卫神殿的西娜（北乃きい 配音）、凯宾（岸祐二 配音）帮助了他们，能与神奇宝贝心灵沟通的西娜还熄灭了冥王龙的怒火。从西娜口中得知，创造了世界的神奇宝贝即将苏醒，它不仅会使时空扭曲错乱，还将为世界带来毁灭性的灾难…… 本片为神奇宝贝系列第十二部电影剧场版。
演员：大原沙耶香 福山润 中井和哉 伊藤静 菊地美香 望月久代 矢岛晶子 武藤寿美 长岛雄一 藤田圭宣 保村真 铃木晶子 加藤英美里 水泽史绘 柿原彻也 铃木达央 浅沼晋太郎 下野纮 深泽岚 本名阳子 仙台惠理 那须惠 成田纱矢香 川村万梨阿 能登麻美子 中村千绘 川澄绫子 野田顺子 饭冢雅弓 冰上恭子 川田绅司 福原耕平 园崎未惠 玉川纱己子 谷育子 雨兰咲木子 小林由美子 古川登志夫 岛本须美 池田昌子 川上伦子
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演员：山下大辉 鸟海浩辅 福岛润 岸尾大辅 松冈祯丞 宫田幸季 诹访彩花 诹访部顺一 潘惠美 安元洋贵 森久保祥太郎 伊藤健太郎 代永翼 阿部敦 野岛健儿 宫野真守 前野智昭 吉野裕行 柿原彻也 日野聪
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